结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.111(4.15~4.21)
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2024.4.15~2024.4.21
CNS刊登文章
01
Nature
2024/4/17
01
“Promiscuous G-protein activation by the calcium-sensing receptor”
通过钙传感受体的混杂G蛋白激活
人类钙传感受体（CaSR）可检测细胞外Ca2+浓度的波动，并维持Ca2+的平衡。它还介导与Ca2+平衡无关的多种细胞过程。CaSR的功能多样性部分源于它能够通过多种G蛋白亚型发出信号。
来自美国哥伦比亚大学的Qing R. Fan和Jonathan A. Javitch以及来自澳大利亚悉尼大学的Arthur D. Conigrave团队合作测定了CaSR与三个不同亚家族的G蛋白复合物的结构：Gq、Gi和Gs。研究人员发现，每个复合体的同源二聚体CaSR都通过一种共同的模式与单个G蛋白耦合。这涉及每个Gα亚基的C端螺旋与一个浅口袋的结合，该浅口袋在一个CaSR亚基中由所有三个胞内环（ICL1-ICL3）、一个扩展的跨膜螺旋和一个有序的C端区域形成。G蛋白结合会扩大跨膜二聚体界面，磷脂会进一步稳定该界面。受体二聚体施加的约束与ICL2结合，通过促进Gα的构象转变来激活G蛋白。研究人员确定了决定Gq和Gs对Gi选择性的一个Gα残基。ICL2的长度和灵活性使CaSR能够结合所有三种Gα亚型，从而赋予了混杂G蛋白偶联的能力。
2024/4/17
02
“Streptomyces umbrella toxin particles block hyphal growth of competing species”
链霉菌伞状毒素颗粒阻断竞争菌丝生长
链霉菌是一种普遍存在的土壤细菌，临床上使用的大多数抗生素都是由链霉菌衍生的。这些抗菌分子的产生反映了链霉菌与其他细菌(包括其他链霉菌种类)的之间激烈的竞争。
来自美国华盛顿大学Joseph D. Mougous课题组研究表明，除了小分子抗生素外，链霉菌还能生产和分泌含有多变重复序列的大型蛋白质复合体，这些蛋白质复合体具有抗菌作用。通过冷冻电镜的结构分析，发现这些复合体具有一个长柄和一个由毒素重复序列支撑的环状顶部，顶部有五个带有凝集素（一种糖结合蛋白）的“辐条”，因此被命名为“伞状颗粒”。链霉菌Streptomyces coelicolor可以编码三种不同毒素和凝集素组成的伞状颗粒。研究发现，这些毒素的上清液能特异性且强效地抑制选定的链霉菌种类的生长，例如对Streptomyces griseus的抑制依赖于单一毒素，该毒素作用会迅速停止目标细菌的菌丝体生长。研究表明，伞状颗粒在不同种的链霉菌之间的竞争中发挥作用，这一功能与小分子抗生素不同。小分子抗生素通常在生殖生长开始时产生，作用范围广泛。通过序列分析，研究者还发现，伞状颗粒的作用可能不限于链霉菌，因为在放线菌门中发现了近1000种细菌的伞状基因位点。
2024/4/17
03
“Stepwise activation of a metabotropic glutamate receptor”
代谢型谷氨酸受体的逐步激活
代谢型谷氨酸受体属于G蛋白偶联受体家族，它们是二聚体，具有一个大的细胞外配体结合结构域，该结构域通过富含半胱氨酸的结构域与其七次跨膜结构域连接。激活后，这些受体发生大的构象变化，将配体结合信号从细胞外配体结合结构域传递到G蛋白偶联的七次跨膜结构域。
来自美国斯坦福大学医学院Brian K. Kobilka和Kaavya Krishna Kumar课题组合作提出了一个代谢型谷氨酸受体5型的逐步、多步骤激活机制的模型。研究人员在脂质纳米盘中呈现了一系列结构，从非活性到完全激活，包括激动剂结合的中间状态。此外，研究人员利用大分子和单分子荧光成像，揭示了变构调节剂和G蛋白结合时受体的不同构象。
02
Science
本周无
03
Cell
本周无
2024.4.15~2024.4.21
子刊刊登文章
01
Cell Research
4.19
1. “Structural basis for the recognition of HCoV-HKU1 by human TMPRSS2”
人类TMPRSS2识别HCoV-HKU1的结构基础
4.19
2. “Human tumor suppressor PDCD4 directly interacts with ribosomes to repress translation”
人类肿瘤抑制因子PDCD4直接与核糖体相互作用以抑制翻译
02
Molecular Cell
本周无
03
Nature Structural & Molecular Biology
4.16
1. “Molecular basis of Gabija anti-phage supramolecular assemblies”
Gabija抗噬菌体超分子装配的分子基础
4.17
2. “HS-AFM single-molecule structural biology uncovers basis of transporter wanderlust kinetics”
HS-AFM单分子结构生物学揭示转运蛋白漫游动力学基础
3. “Vimentin filaments integrate low-complexity domains in a complex helical structure”
波形蛋白纤维在复杂螺旋结构中整合低复杂度域
04
Nature Communications
4.15
1. “Dynamic inter-domain transformations mediate the allosteric regulation of human 5, 10-methylenetetrahydrofolate reductase”
动态的结构域转变介导人类5,10-甲基四氢叶酸还原酶的异构体调节
4.15
2. “A widely conserved protein Rof inhibits transcription termination factor Rho and promotes Salmonella virulence program”
广泛保守的蛋白质Rof抑制转录终止因子Rho并促进沙门氏菌的致病程序
4.15
3. “Sm-like protein Rof inhibits transcription termination factor ρ by binding site obstruction and conformational insulation”
类似Sm蛋白的Rof通过结合位点阻塞和构象隔离抑制转录终止因子ρ
4.16
4. “Cryo-EM structures of adenosine receptor A3AR bound to selective agonists”
冷冻电镜结构揭示与选择性激动剂结合的腺苷受体A3AR
4.16
5. “Mechanism and structural dynamics of sulfur transfer during de novo [2Fe-2S] cluster assembly on ISCU2”
硫转移过程中ISCU2上新生[2Fe-2S]簇的组装机制与结构动态
4.16
6. “Emerging variants develop total escape from potent monoclonal antibodies induced by BA.4/5 infection”
新兴变异株完全逃避BA.4/5感染诱导的强效单克隆抗体
4.16
7. “Insights into the inhibition of protospacer integration via direct interaction between Cas2 and AcrVA5”
通过Cas2和AcrVA5的直接相互作用洞察原位片段整合的抑制
4.16
8. “Exposing the molecular heterogeneity of glycosylated biotherapeutics”
揭示糖基化生物治疗剂的分子异质性
4.17
9. “The DEAD-box ATPase Dbp10/DDX54 initiates peptidyl transferase center formation during 60S ribosome biogenesis”
DEAD-box ATP酶Dbp10/DDX54在60S核糖体生物合成过程中启动肽链转移中心的形成
4.18
10. “RNA targeting and cleavage by the type III-Dv CRISPR effector complex”
III-Dv型CRISPR效应复合体的RNA靶向与切割
4.18
11. “Structural basis for antiepileptic drugs and botulinum neurotoxin recognition of SV2A”
抗癫痫药物和肉毒神经毒素识别SV2A的结构基础
4.18
12. online “Modulation of peroxisomal import by the PEX13 SH3 domain and a proximal FxxxF binding motif”
PEX13 SH3域及邻近的FxxxF结合基序调控过氧化物酶体的导入
4.18
13. “Shining light on dinoflagellate photosystem I”
照亮藻类光合系统I的光
4.20
14. “GENESIS CGDYN: large-scale coarse-grained MD simulation with dynamic load balancing for heterogeneous biomolecular systems”
GENESIS CGDYN: 对异质生物分子系统进行大规模粗粒度MD模拟，并实现动态负载平衡
05
Science Advances
4.17
1. “Electron videography of a lipid–protein tango”
电子摄影揭示脂质-蛋白质的交互舞蹈
4.17
2. “Structural insights into the unexpected agonism of tetracyclic antidepressants at serotonin receptors 5-HT1eR and 5-HT1FR”
四环类抗抑郁药在5-HT1eR和5-HT1FR血清素受体上的意外激动作用的结构洞察
作者 | 谭佳鑫
审稿 | 肖媛
责编 | 囡囡
设计 / 排版 | 可洲 王婧曈
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